Identifikasi Molekuler Ikan Kembung (Rastrelliger spp.) di Laut Jawa dan Selat Madura sebagai Dasar Pengelolaan

Abstract

Ikan kembung (Rastrelliger spp.) merupakan ikan pelagis kecil dan ekonomis penting yang biasa ditemukan di perairan Indonesia. Ikan kembung ditemukan di Laut Jawa dan Selat Madura dan menjadi salah satu target utama dalam perikanan tangkap. Identifikasi spesies yang akurat merupakan informasi penting untuk tujuan manajemen yang lebih baik. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi secara molekuler spesies ikan kembung dengan menggunakan marka COI di wilayah tersebut. Sebanyak 15 ekor ikan kembung dikumpulkan dan diawetkan dengan menggunakan alkohol 96%. Di laboratorium, jaringan yang diambil dari bagian belakang sirip dorsal diisolasi dan diekstraksi, kemudian diamplifikasi dengan PCR sebelum proses sekuensing. Hasil sekuensing divalidasi pada BLASTn, menunjukkan bahwa 12 contoh termasuk R. kanagurta dan 3 contoh termasuk R. brachysoma dengan kemiripan sekuen 98-100%. Sekuen basa nukleotida kemudian dianalisis menggunakan software MEGA 7.0. Jarak genetik ikan kembung di perairan tersebut menunjukkan kekerabatan yang dekat. Hasil pohon filogeni menunjukkan pencampuran populasi sehingga ikan kembung di perairan tersebut dapat dikelola dalam satu unit pengelolaan.