Variasi Genetik Undur-Undur Laut (Emerita emeritus Linnaeus, 1767) Menggunakan Marka Gen COI di Pesisir Sukabumi

Abstract

Undur-undur laut di Indonesia dapat ditemukan di pantai berpasir, terutama pada wilayah pantai selatan Jawa dan pantai barat Sumatera. Salah satu jenis undur-undur laut yang banyak dijumpai di pantai selatan Jawa adalah undur-undur laut jenis Emerita emeritus. Informasi mengenai variasi genetik dapat dijadikan input untuk pengelolaan Emerita emeritus. Penelitian ini dilakukan untuk menduga variasi genetik berdasarkan DNA mitokondria dari Emerita emeritus menggunakan teknik DNA Barcoding dengan penanda gen COI. Analisis molekuler melalui tahap preparasi contoh, isolasi dan ekstrasi DNA, elektroforesis, amplifikasi DNA, dan sekuensing basa nukleotida. Hasil sekuensing diolah menggunakan program MEGA 5 dan informasi variasi genetik diperoleh melalui program DNAsp 5. Hasil analisis molekuler menunjukkan bahwa spesies contoh memiliki kekerabatan yang dekat antar spesies ataupun antar populasi. Variasi haplotipe spesies contoh dari pantai berpasir Kabupaten Sukabumi, Cilacap dan Kebumen dalam kategori yang tinggi, sehingga dapat diduga variasi genetik berdasarkan DNA mitokondria dari spesies contoh juga dalam kategori yang tinggi.