Analisis urutan nukleotida fragmen D-Loop lumba-lumba hidung botol (Tursiops aduncus)

Abstract

Lumba-lumba hidung botol Indo-Pasifik (T. aduncus) adalah spesies sosial yang memiliki daerah distribusi yang luas di perairan temperate dan tropis. Gelanggang Samudera Ancol (GSA) memiliki koleksi lumba-lumba hidung botol yang relatif banyak, sembilan diantaranya telah dianalisis fragmen D-Loop sepanjang 392 pb berdasarkan amplifikasi PCR dengan primer spesifik. Hasil analisis filogenetik dengan piranti lunak MEGA versi 3.1 menunjukkan bahwa kesembilan individu tersebut tergolong dalam spesies T.aduncus, kesimpulan ini didukung pula oleh ciri morfologi dan analisis fragmen DLoop. Pembandingan dengan T.truncatus dan T.aduncus yang berasal dari perairan lain seperti Australia dan Cina diketahui bahwa enam individu memiliki hubungan lebih dekat dengan T.aduncus asal perairan Australia (persamaan 99.22%) sedangkan tiga individu lainnya memiliki hubungan lebih dekat dengan T.aduncus asal perairan Cina (persamaan 99.08%). Hal ini memberi indikasi bahwa T.aduncus yang ada diperairan Indonesia merupakan percampuran dari dua perairan tersebut. Diketahui pula bahwa T.aduncus asal GSA berbeda dari T.truncatus (nilai dissimilarity 2.5%) yang ditandai oleh 11 situs diagnostik.