Homogenitas, Stabilitas, dan Konfirmasi PCR Objek Uji Profisiensi E.coli Kering Beku

Abstract

Objek uji profisiensi parameter bakteri E.coli harus memenuhi syarat, yaitu homogen dan stabil. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan jenis krioprotektan dengan viabilitas biakan kering beku E.coli yang baik, mengevaluasi tingkat homogenitas dan stabilitas biakan kering beku E.coli, dan mengonfirmasi menggunakan PCR dengan primer 16S rRNA. Metode dalam penelitian ini adalah uji krioprotektan yang memperoleh viabilitas paling tinggi, uji homogenitas dan stabilitas biakan kering beku secara kualitatif dan kuantitatif, dan uji konfirmasi menggunakan primer 16S rRNA E.coli dengan PCR. Krioprotektan yang memberikan viabilitas terbaik untuk biakan kering beku E.coli adalah 20% susu skim. Hasil uji homogenitas dan stabilitas secara kualitatif menunjukkan hasil homogen dan stabil. Hasil uji homogenitas dan stabilitas secara kuantitatif menunjukkan biakan kering beku E.coli homogen dan stabil pada standar deviasi 25%. Pemilihan primer ECO-1 dan ECO-2 pada penelitian ini berdasarkan kesesuaiannya terhadap bakteri E.coli, panjang primer, nilai Tm dan selisih antara Tm primer forward dan reverse, %GC, serta nilai self complimentarity dan self 3’ complimentarity. Kultur murni dan sampel biakan kering beku E.coli terkonfirmasi menggunakan PCR dengan primer ECO-1 dan ECO-2.