View Item 
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Forestry
      • UT - Silviculture
      • View Item
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Forestry
      • UT - Silviculture
      • View Item
      JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

      Referensi Awal DNA Barcode pada Famili Anacardiaceae

      Thumbnail
      View/Open
      Fulltext (18.55Mb)
      Date
      2019
      Author
      Ryadi, Alberto Hamid
      Siregar, Iskandar Z
      Amandita, Fitri Yola
      Metadata
      Show full item record
      Abstract
      Anacardiaceae merupakan salah satu famili penting di Indonesia yang keberadaan sumberdaya genetiknya mulai terancam akibat dari kerusakan alam, namun identifikasi jenis secara molekuler pada famili tersebut belum menyeluruh. Tujuan penelitian ini adalah untuk mendapatkan penanda genetik yang sesuai dan efektif dalam mengidentifikasi famili Anacardiaceae dengan metode DNA barcoding. Penanda genetik yang digunakan adalah penanda tunggal yaitu matK dan rbcL, serta penanda kombinasi matK+rbcL. Penelitian ini menggunakan data EFForTS sebanyak 28 sampel dengan penanda matK dan 31 sampel menggunakan penanda rbcL. Selain itu juga ditambahkan data dari Genbank sebanyak 24 sampel dengan penanda matK dan 19 sampel dengan penanda rbcL. Akurasi identifikasi pada tingkat spesies tertinggi dengan penanda matK yaitu sebesar 28.57%, sedangkan rbcL sebesar 22.58%, dan matK+rbcL sebesar 19.23%. Dalam penelitian ini, penanda matK, rbcL, dan matK+rbcL tidak dapat membentuk barcoding gap yang jelas, namun hasil t-test menunjukkan bahwa intraspesifik dan interspesifik dengan kedua penanda tersebut berbeda secara signifikan. Penanda matK dan rbcL berhasil membentuk grup-grup monofiletik dalam pohon filogeni untuk masing-masing spesies.
      URI
      http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/99125
      Collections
      • UT - Silviculture [1173]

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository
        

       

      Browse

      All of IPB RepositoryCollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

      My Account

      Login

      Application

      google store

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository