Referensi Awal DNA Barcode pada Famili Anacardiaceae
View/ Open
Date
2019Author
Ryadi, Alberto Hamid
Siregar, Iskandar Z
Amandita, Fitri Yola
Metadata
Show full item recordAbstract
Anacardiaceae merupakan salah satu famili penting di Indonesia yang
keberadaan sumberdaya genetiknya mulai terancam akibat dari kerusakan alam,
namun identifikasi jenis secara molekuler pada famili tersebut belum menyeluruh.
Tujuan penelitian ini adalah untuk mendapatkan penanda genetik yang sesuai dan
efektif dalam mengidentifikasi famili Anacardiaceae dengan metode DNA
barcoding. Penanda genetik yang digunakan adalah penanda tunggal yaitu matK
dan rbcL, serta penanda kombinasi matK+rbcL. Penelitian ini menggunakan data
EFForTS sebanyak 28 sampel dengan penanda matK dan 31 sampel menggunakan
penanda rbcL. Selain itu juga ditambahkan data dari Genbank sebanyak 24 sampel
dengan penanda matK dan 19 sampel dengan penanda rbcL. Akurasi identifikasi
pada tingkat spesies tertinggi dengan penanda matK yaitu sebesar 28.57%,
sedangkan rbcL sebesar 22.58%, dan matK+rbcL sebesar 19.23%. Dalam
penelitian ini, penanda matK, rbcL, dan matK+rbcL tidak dapat membentuk
barcoding gap yang jelas, namun hasil t-test menunjukkan bahwa intraspesifik dan
interspesifik dengan kedua penanda tersebut berbeda secara signifikan. Penanda
matK dan rbcL berhasil membentuk grup-grup monofiletik dalam pohon filogeni
untuk masing-masing spesies.
Collections
- UT - Silviculture [1173]