Karakterisasi Molekuler Spodoptera Litura Nucleopolyhedrovirus (SpltNPV) dari Kabupaten Sukabumi, Jawa Barat.

Abstract

Ulat grayak (Spodoptera litura) adalah salah satu serangga hama pertanaman penting hampir di seluruh dunia. Serangan dari hama ini mengakibatkan penurunan hasil produksi hingga 90% di beberapa negara. Nucleopolyhedrovirus diketahui memiliki inang lebih dari 400 spesies serangga. S. litura NPV merupakan anggota Alphabaculovirus. Keragaman genetik tidak hanya terjadi pada spesies yang berbeda, pada spesies yang sama dapat terjadi perbedaan genetik yang terpengaruh lingkungan hidupnya. Penelitian ini bertujuan mengetahui karakterisasi molekuler NPV pada larva S. litura dengan menggunakan skuen DNA polymerase. Isolat NPV merupakan koleksi Laboratorium Patologi Serangga yang berasal dari Kabupaten Sukabumi. DNA isolat tersebut kemudian diekstraksi lalu digunakan sebagai template yang akan diamplifikasi dengan primer yang telah disediakan, lalu dilakukan uji homologi dan filogeni. Hasil amplifikasi menunjukkan bahwa isolat SpltNPV Kab. Sukabumi memiliki hubungan kekerabatan yang tinggi dengan isolat NPV yang menginfeksi genus Spodoptera asal Cina, Australia, Kanada dan Amerika Serikat dengan nilai homologi nukleotida dan asam amino lebih dari 80%. Berdasarkan hasil analisis filogeni, isolat SpltNPV Kab. Sukabumi termasuk dalam grup yang sama dengan NPV yang menyerang genus Spodoptera dari Cina, Australia, Kanada dan Amerika Serikat.