Integrasi Protein-Protein Interaction (PPI) , Pathway, Module, dan Orthology untuk Menentukan Skor pada Module
Abstract
Penelitian di bidang biologi molekuler menghasilkan data-data biologi
molekuler dalam jumlah besar. Data ini umumnya disebut sebagai data omics. Data
Proteomics adalah sub bagian dari omics yang berhubungan dengan protein. Protein
merupakan komponen utama pada mahkluk hidup. Protein dapat berinteraksi
dengan DNA, RNA, dan sesama protein. Interaksi antara protein dikenal dengan
istilah protein protein interaction (PPI). PPI dapat diintegrasikan dengan objek
bioinformatika lainnya. Hasil integrasi PPI memberikan pengetahuan bagaimana
proses biologis bekerja. Penelitian ini mengintegrasikan PPI dengan pathway,
module, dan orthology. Penelitian ini juga melakukan analisis dengan menghitung
nilai skor module pada data yang telah diintegrasikan untuk menentukan module
yang paling berpengaruh terhadap protein. Penelitian ini menggunakan protein
insulin dan xanthine dehydrogenase sebagai studi kasus. Pada penelitian ini
didapatkan module JAK-STAT dan PI3K-AKT sebagai module dengan skor
tertinggi pada protein INS, serta module inosine monophospate pada protein XDH.
Collections
- UT - Computer Science [2322]