Integrasi Protein-Protein Interaction (PPI) , Pathway, Module, dan Orthology untuk Menentukan Skor pada Module

Abstract

Penelitian di bidang biologi molekuler menghasilkan data-data biologi molekuler dalam jumlah besar. Data ini umumnya disebut sebagai data omics. Data Proteomics adalah sub bagian dari omics yang berhubungan dengan protein. Protein merupakan komponen utama pada mahkluk hidup. Protein dapat berinteraksi dengan DNA, RNA, dan sesama protein. Interaksi antara protein dikenal dengan istilah protein protein interaction (PPI). PPI dapat diintegrasikan dengan objek bioinformatika lainnya. Hasil integrasi PPI memberikan pengetahuan bagaimana proses biologis bekerja. Penelitian ini mengintegrasikan PPI dengan pathway, module, dan orthology. Penelitian ini juga melakukan analisis dengan menghitung nilai skor module pada data yang telah diintegrasikan untuk menentukan module yang paling berpengaruh terhadap protein. Penelitian ini menggunakan protein insulin dan xanthine dehydrogenase sebagai studi kasus. Pada penelitian ini didapatkan module JAK-STAT dan PI3K-AKT sebagai module dengan skor tertinggi pada protein INS, serta module inosine monophospate pada protein XDH.