Sensitivitas Metode Serologi dan Polymerase Chain Reaction untuk Deteksi Virus pada Bawang (Allium spp.).

Abstract

Infeksi Onion yellow dwarf virus (OYDV), Shallot yellow stripe virus (SYSV) dan Garlic common latent virus (GCLV) sudah banyak dilaporkan di Indonesia. Metode serologi yang sering digunakan untuk deteksi virus pada tanaman adalah enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), dan dot immuno binding assay (DIBA); sedangkan metode molekuler polymerase chain reaction (PCR) merupakan metode molekuler yang banyak digunakan saat ini. Penelitian ini bertujuan mengevaluasi tiga metode deteksi virus, yaitu ELISA, DIBA dan PCR sebagai metode yang akurat dan sensitif untuk mendeteksi virus pada tanaman bawang. Batas sensitivitas tiap metode diuji dengan beberapa tingkat pengenceran cairan perasan tanaman dan antibodi untuk ELISA dan DIBA, serta pengenceran cDNA untuk metode RT-PCR. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa metode DIBA dapat mendeteksi OYDV, GCLV, dan SYSV hingga pengenceran antigen berkisar antara 10-1 hingga 10-2, dengan pengenceran antibodi berkisar antara 1:300 hingga 1:1000. Metode ELISA dapat mendeteksi virus yang sama hingga pengenceran antigen 10-1, 10-3, dan 10-5, dengan pengeceran antibodi berkisar 1:300 hingga 1:1000. Metode PCR merupakan metode yang paling sensitif dibandingkan dengan ELISA dan DIBA karena memiliki akurasi, spesifikasi, efisiensi, dan batas sensitivitas yang lebih tinggi. Metode PCR dapat mendeteksi Potyvirus dan Carlavirus hingga pengenceran cDNA 10-3 dan 10-4, sedangkan deteksi dengan primer spesifik dinilai lebih sensitif karena dapat mengamplifikasi OYDV, GCLV, dan SYSV hingga pengenceran cDNA 10-5.