View Item 
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Forestry
      • UT - Silviculture
      • View Item
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Forestry
      • UT - Silviculture
      • View Item
      JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

      Perbandingan Dua Metode Isolasi DNA pada 49 Jenis Kayu Tropis

      Thumbnail
      View/Open
      Fulltext (10.92Mb)
      Date
      2017
      Author
      Ramdhani, Muhammad Jauhari
      Siregar, Iskandar Zulkarnaen
      Metadata
      Show full item record
      Abstract
      Keberhasilan ekstraksi DNA (Deoxyribonucleic Acid) sangat penting bagi proses investigasi genetika kehutanan molekuler. Penggunaan sampel biasanya berupa organ tanaman hutan yang lunak dan muda karena memiliki sumber DNA yang bagus. Namun, jenis sampel tersebut tidak dapat diperoleh dalam kasus tertentu seperti untuk tujuan forensik. Sebagai penggantinya, kayu memiliki potensi sebagai sumber DNA dimana metode ekstraksinya sudah dikembangkan dengan berbagai tingkat keberhasilan, akan tetapi pengujian efektifitasnya pada kayu tropis yang tumbuh di Indonesia belum pernah dilaporkan. Tujuan penelitian ini adalah untuk membandingkan hasil isolasi DNA dari berbagai jenis sampel kayu kering dan segar menggunakan dua metode isolasi yaitu Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide (CTAB) dan Qiagen DNeasy Plant Mini Kit (QDPMK). Hasil ekstraksi divisualisasi dalam gel agarosa, dikuantifikasi menggunakan Nanophotometer NP80 Implen dan diamplifikasi menggunakan dua primer universal yaitu ITS dan rbcL. Hasil ekstraksi sampel kayu kering tidak tervisualisasi pada gel sedangkan sampel kayu segar menunjukkan sapuan (smear) yang cukup tebal untuk kedua metode ekstraksi. Hasil uji kuantitas menunjukkan bahwa sampel yang diekstraksi menggunakan metode CTAB memiliki konsentrasi lebih banyak dibandingkan dengan metode QDPMK pada kedua jenis sampel, namun memiliki nilai optical density ratios diluar rentang kemurnian (λ260/280 : 1,8 – 2,0 dan λ260/230 : 2,0). Keberhasilan proses amplifikasi primer ITS dan rbcL pada sampel kering cukup rendah namun tidak berbeda jauh pada kedua metode. Hasil amplifikasi ITS dan rbcL pada sampel kayu segar memiliki keberhasilan yang cukup tinggi.
      URI
      http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/89971
      Collections
      • UT - Silviculture [1096]

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository
        

       

      Browse

      All of IPB RepositoryCollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

      My Account

      Login

      Application

      google store

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository