Pengaruh Mutasi Titik Terhadap Trayektori Unfolding Dan Refolding Protein 1gb1
View/ Open
Date
2015Author
Aldrifisia, Della Tiaraputri
Sumaryada, Tony Ibnu
Wahyudi, Setyanto Tri
Metadata
Show full item recordAbstract
Mekanisme pelipatan protein merupakan hal yang sangat penting untuk
memahami berbagai proses biologi. Salah satunya adalah proses unfolding dan
refolding protein 1GB1 yang telah termutasi pada salah satu residunya. Penelitian
ini bertujuan untuk mempelajari pengaruh mutasi titik terhadap dinamika proses
unfolding dan refolding protein 1GB1 serta membandingkan trayektori unfolding
dan refolding protein 1GB1 yang telah dimutasi dan tidak dimutasi. Penelitian ini
dilakukan menggunakan metode simulasi dinamika molekul yang terdiri dari
beberapa tahapan diantaranya preparasi dan mutasi protein, minimisasi,
pemanasan atau pendinginan, ekuilibrasi, dan production run. Simulasi unfolding
dilakukan pada suhu 500 K selama 2 ns dan refolding pada suhu 200 K selama 20
ns. Mutasi titik yang dilakukan mengakibatkan meningkatnya kestabilan termal
protein sehingga protein mutan membutuhkan waktu lebih lama baik untuk
denaturasi maupun kembali ke native state. Proses unfolding dan refolding protein
memiliki trayektori yang berbeda, simulasi refolding membutuhkan waktu yang
jauh lebih panjang daripada simulasi unfolding agar struktur protein dapat kembali
ke keadaan awal (native state).
Collections
- UT - Physics [1095]