Show simple item record

dc.contributor.advisorKusuma, Wisnu Ananta
dc.contributor.authorDinilhak, Afdhal
dc.date.accessioned2015-04-30T06:29:18Z
dc.date.available2015-04-30T06:29:18Z
dc.date.issued2015
dc.identifier.urihttp://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/74945
dc.description.abstractBioinformatika memiliki banyak bidang kajian penting dan terus berkembang, salah satunya adalah analisis metagenom. Metagenom merupakan materi genetik yang diperoleh dari sampel yang langsung diambil dari lingkungan tanpa budidaya di laboratorium. Untuk mengklasifikasikan fragmen metagenom ke dalam tingkat taksonomi yang berbeda perlu dilakukan proses binning. Pada penelitian ini dilakukan proses binning dengan pendekatan komposisi menggunakan metode supervised learning. Proses klasifikasi dilakukan dengan menggunakan Support Vector Machine (SVM) sebagai classifier, perhitungan frekuensi k-mers untuk mengekstraksi fitur, dan Fast Correlation Based Filter (FCBF) sebagai penyeleksi fitur. Pada proses seleksi fitur, jumlah fitur yang terseleksi ditentukan oleh nilai threshold. Dari penelitian ini akurasi hasil klasifikasi SVM dengan seleksi fitur berkisar antara 79.13% sampai 96.68% untuk 3-mers, sedangkan jika menggunakan 4-mers akurasi berkisar antara 83.59% sampai 99.35%.en
dc.language.isoid
dc.subject.ddcComputer Scienceen
dc.titleKlasifikasi Fragmen Metagenom Menggunakan Metode SVM dan Fast Correlation Based Filter sebagai Penyeleksi Fituren
dc.subject.keywordmetagenomen
dc.subject.keywordbinningen
dc.subject.keywordk-mersen
dc.subject.keywordfeature selectionen
dc.subject.keywordfast correlation based filteren
dc.subject.keywordthresholden
dc.subject.keywordSVMen


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record