Dinamika dan Interaksi Soliton DNA Model Peyrard-Bishop-Dauxois dengan Aproksimasi Potensial Morse Orde Lima

Abstract

DNA model PBD (perpanjangan dari model Peyrard-Bishop) merupakan model DNA yang menggambarkan denaturasi (replikasi) DNA. Tulisan ini menjelaskan makna fisis dari solusi numerik DNA model PBD dengan aproksimasi potensial morse hingga orde lima dalam efek gangguan pada dinamika gelombang soliton DNA. Dengan menggunakan metode finite-difference yang dibantu metode interpolasi Lagrange diperoleh solusi numerik dinamika soliton DNA model PBD yang diberikan gangguan pada solusi stabilnya. Pengaruh gangguan dengan mengalikan nilai (1+ɛ) pada solusi stabilnya dapat terlihat pada peristiwa undulasi (dimana terjadi penyempitan soliton dan kenaikan amplitudo), sedangkan gangguan beda fase (θ=0,π/2 dan π) tidak memberikan pengaruh yang cukup signifikan terhadap kondisi selanjutnya.