Deteksi Gen Resistansi Antibiotik Makrolida pada Isolat Escherichia coli dari Kotoran Sapi Perah di Kota Bogor

Abstract

Resistansi antimikrob merupakan ancaman global bagi kesehatan manusia, hewan, dan lingkungan. Peternakan sapi perah berpotensi menjadi reservoir bakteri resistan akibat penggunaan antibiotik. Penelitian ini bertujuan mendeteksi gen resistansi makrolida pada isolat Escherichia coli dari kotoran sapi perah di Kota Bogor. Sampel diambil dari 15 peternakan di Kelurahan Kebon Pedes yang telah dikonfirmasi pada penelitian sebelumnya. Kemudian dilakukan deteksi gen resistansi dengan MinION Oxford Nanopore Technologies dan dilanjutkan analisis bioinformatika. Hasil menunjukkan 13 dari 15 isolat (86,67%) membawa gen resistansi makrolida, dengan gen mef(B)_1 terdeteksi di 7 peternakan (46,97%) dan gen mph(A)_2 terdeteksi di 6 peternakan (40,02%) Gen mef(B)_1 lebih dominan pada isolat E. coli dibandingkan gen mph(A)_2 dan kedua gen umumnya berada pada plasmid. Temuan ini menunjukkan bahwa lingkungan peternakan sapi perah berpotensi menjadi reservoir gen resistansi makrolida.