EKSTRAKSI DNA DARI TELUR NEMATODA STRONGYLE UNTUK POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR)

Abstract

Ekstraksi DNA dari telur nematoda strongyle diperlukan untuk memperoleh DNA template yang dapat digunakan dalam analisis molekuler berbasis Polymerase Chain Reaction (PCR). Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi keberhasilan ekstraksi DNA dari telur nematoda strongyle hasil flotasi sebagai DNA template untuk amplifikasi PCR dan mengevaluasi penggunaan dua volume reaksi PCR yang berbeda. Sampel feses domba diperiksa terhadap telur strongyle menggunakan metode flotasi dengan larutan NaCl jenuh. Telur yang diperoleh dibersihkan dan DNA diekstraksi menggunakan lysis solution. DNA template hasil ekstraksi diamplifikasi menggunakan primer ITS–2G dengan dua variasi volume Master Mix PCR, yaitu 10 µL dan 25 µL, hasilnya divisualisasikan melalui elektroforesis gel agarosa 1%. Hasil penelitian menunjukkan bahwa seluruh sampel uji menghasilkan pita DNA berukuran sekitar 370 bp sesuai target primer ITS-2G, yang menunjukkan bahwa DNA hasil ekstraksi dapat diamplifikasi menggunakan PCR. Volume reaksi 10 µL menghasilkan hasil pita DNA yang sebanding dengan volume 25 µL. Dengan demikian, ekstraksi DNA dari telur nematoda strongyle hasil flotasi dapat menghasilkan DNA template yang layak digunakan untuk amplifikasi PCR.