Analisis Single Nucleotide Polymorphism sengon (Falcataria falcata) dari elevasi berbeda untuk toleransi terhadap penyakit karat tumor

Abstract

Sengon (Falcataria falcata) adalah tanaman rentan terhadap penyakit karat tumor yang disebabkan oleh jamur Uromycladium falcatariae yang mampu menginfeksi jaringan tanaman yang muda sehingga menghambat pertumbuhan sengon. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh elevasi tempat terhadap intensitas serangan penyakit dan menganalisis serta menguji marka SNPs pada aksesi sengon yang rentan dan resisten terhadap penyakit karat tumor. Penelitian dilakukan di hutan masyarakat Kabupaten Trenggalek pada elevasi 0–500 dan 501–1.000 mdpl. DNA diekstraksi dari sampel daun 25 pasang aksesi sengon rentan dan resisten pada elevasi 0-500 mdpl dan 501-1000 mdpl. Validasi SNP dilakukan menggunakan High Resolution Melting (HRM) dengan primer IAA_1, IAA_2, NUOR_1, NUOR_3, WRKY_11, dan WRKY40. Tingkat serangan tertinggi pada elevasi 501–1.000 mdpl dan signifikan secara statistik. Uji khi-kuadrat menunjukkan primer WRKY_40 paling signifikan pada elevasi 0–500 mdpl, sedangkan NUOR_3 paling signifikan pada elevasi 501–1.000 mdpl. Analisis PCA dengan enam primer belum mampu memisahkan aksesi resisten dan rentan secara jelas pada kedua elevasi yang berbeda, namun terdapat aksesi resisten dan rentan yang berhasil memisah pada elevasi 501- 1000 mdpl.