Show simple item record

dc.contributor.advisorSiregar, Iskandar Zulkarnaen
dc.contributor.advisorPratama, Rahadian
dc.contributor.authorAryana, Ayundra Maharani Manitya
dc.date.accessioned2024-02-11T23:36:02Z
dc.date.available2024-02-11T23:36:02Z
dc.date.issued2024
dc.identifier.urihttp://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/137989
dc.description.abstractInformasi genetik dapat digunakan dalam upaya konservasi dengan menduga keragaman genetik melalui penggunaan marka genetik. Sekuens DNA dapat diperoleh melalui tahap ekstraksi, isolasi, dan sekuensing. Sekuensing dapat dilakukan menggunakan mesin dengan teknologi terbaru seperti teknologi ONT, namun jarang sekali diaplikasikan pada pohon hutan. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan sekuens DNA dan melakukan analisis filogenetik beberapa jenis pohon hutan, yaitu merbau (Intsia bijuga), cendana (Santalum album), dan kelor (Moringa oleifera). Tahapan penelitian mencakup perolehan data hasil sekuensing dan basecalling, quality check, assembly, polishing, anotasi, analisis kekerabatan, serta konstruksi pohon filogenetik. Analisis kekerabatan dilakukan menggunakan DNA sekuens berupa intergenic spacer trnH-psbA, accD, dan matK. Hasil analisis kekerabatan menunjukkan bahwa pohon filogenetik jenis merbau, cendana, dan kelor memiliki nilai bootstrap yang bervariasi yaitu masing-masing sebesar 0,965 (96,5%), 0,509 (50,9%), dan 0,798 (79,8%).id
dc.language.isoidid
dc.publisherIPB Universityid
dc.titleAnalisis Long-Read Sequences DNA Jenis Merbau (Intsia bijuga), Cendana (Santalum album), dan Kelor (Moringa oleifera)id
dc.title.alternativeAnalysis of Long-Read Sequences DNA on Merbau (Intsia bijuga), Sandalwood (Santalum album), and Moringa (Moringa oleifera)id
dc.typeUndergraduate Thesisid
dc.subject.keywordaccDid
dc.subject.keywordanalisis filogenetikid
dc.subject.keywordlong-read sequenceid
dc.subject.keywordmatKid
dc.subject.keywordtrnH-psbAid


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record