Analisis Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) Aksesi Sengon (Falcataria moluccana) Resistan dan Rentan Terhadap Penyakit Karat Puru

Abstract

Sengon banyak ditanam dan dimanfaatkan karena memiliki banyak keunggulan, yaitu bernilai ekonomi tinggi, cepat panen, mudah tumbuh dan dipelihara. Namun, sengon yang ditanam monokultur rentan terkena penyakit karat puru yang disebabkan oleh jamur Uromycladium falcatariae. Tujuan penelitian ini adalah mengevaluasi pertumbuhan uji keturunan sengon di Kediri serta aplikasi markah SNPs pada aksesi progeni sengon yang resistan dan rentan terhadap karat puru. Informasi ini diperlukan sebagai dasar pemuliaan pohon sengon yang resistan. Sampel yang diuji berjumlah total 40 progeni dari masing-masing famili resistan (R02, R08, R09, R12, dan R13) serta rentan (S26, S27, S28, S29, dan S30) dengan ulangan 4 progeni tiap famili. Setiap sampel diuji menggunakan 6 primer SNPs dengan metode High-resolution Melting (HRM) dan data dianalisis menggunakan Khi-Kuadrat dan Principal Component Analysis (PCA). Nilai intensitas dan keparahan serangan pada famili resistan dan rentan tidak berbeda nyata. Hasil analisis SNPs menunjukkan bahwa gen berasosiasi dengan sifat resistansi sengon. Analisis PCA menunjukkan 6 primer mampu memisahkan aksesi resistan dan rentan, sehingga markah SNP dapat digunakan untuk seleksi pohon resistan karat puru.