Analisis Network Pharmacology untuk Menemukan Kandidat Senyawa Anti Diabetes Melitus Tipe II pada Tanaman Mangifera Indica
Abstract
Diabetes melitus disebabkan oleh gangguan produksi insulin dalam pankreas
atau karena glukosa yang dibawa insulin tidak dapat diterima oleh sel-sel akibat
terhalang lemak tubuh. Mangifera indica mengandung senyawa yang berpotensi
sebagai antidiabetes. Penelitian ini menerapkan analisis network pharmacology
untuk memvisualisasikan interaksi senyawa pada Mangifera indica dan protein
target diabetes melitus tipe II. Metode soft clustering menggunakan ClusterONE
dilakukan untuk mendapatkan protein signifikan dengan p-value terendah dan nilai
centrality tertinggi. Cluster tersebut terdiri dari 16 protein, yaitu GPD2, GNPAT,
MBOAT1, GPD1, MBOAT2, LPIN1, AGPAT6, GK, ADPRM, GPAM, AGPAT5,
AGPAT4, AGPAT2, AGPAT9, DAK dan GPAT2. Protein-protein ini berasosiasi
dengan senyawa mangiferolic acid dan mangiferonic acid pada tanaman Mangifera
indica dalam mengurai asam lemak tak jenuh yang berpengaruh terhadap resistensi
insulin, sehingga dapat digunakan untuk mencegah komplikasi pada penderita
diabetes. Analisis Gene Ontology dan Pathway menunjukkan bahwa protein protein tersebut berkaitan dengan aktivitas asam lemak pada membaran
mitokondria yang berhubungan dengan patofisiologi diabetes. Diabetes Mellitus are caused by impaired insulin production on the
pancreas or because the glucose carried by insulin can’t be accepted by the cells
due to being blocked by body fat. Mangifera indica contains compound that have
potential as an antidiabetic. This study applies network pharmacology analysis to
visualize the interaction of compound on Mangifera indica and proteins target on
type II diabetes mellitus. The soft clustering method using ClusterONE was carried
out to obtain significant proteins with the lowest p-value and the highest centrality
value. The cluster consists of 16 proteins, namely GPD2, GNPAT, MBOAT1, GPD1,
MBOAT2, LPIN1, AGPAT6, GK, ADPRM, GPAM, AGPAT5, AGPAT4, AGPAT2,
AGPAT9, DAK and GPAT2. These proteins associate with mangiferolic acid and
mangiferonic acid compounds in the Mangifera indica plant to breaking down
unsaturated fatty acids which affect insulin resistance, so they can be used to
prevent complications in diabetics. Gene Ontology and Pathway analysis showed
that these proteins are related to fatty acid activity in mitochondrial membranes
which are related to the pathophysiology of diabetes.
Collections
- UT - Computer Science [2482]
