Identifikasi Helicoverpa armigera Nucleopolyhedrovirus (HearNPV) Asal Jagung Berdasarkan Gen DNA Polimerase

Abstract

Nucleopolyhedovirus (NPV) adalah salah satu patogen serangga yang efektif mengendalikan ulat penggerek tongkol jagung. Helicoverpa armigera salah satu hama penting yang menjadi ancaman terhadap produktivitas jagung. Helicoverpa armigera dapat dikendalikan secara hayati menggunakan Helicoverpa armigera Nucleopolyhedrovirus (HearNPV). Penelitian ini bertujuan mengetahui kekerabatan dari larva Helicoverpa armigera secara molekuler. Amplifikasi dengan PCR menggunakan sepasang primer PSF dan primer PSR, hasil amplifikasi dapat digunakan untuk identifikasi dan mendapatkan informasi hubungan kekerabatan genetik antara HearNPV Bogor dengan isolat NPV yang sudah terdaftar di GenBank. Ukuran fragmen HearNPV yang berhasil diamplifikasi yaitu ± 1300 pb. Perunutan sekuen HearNPV (contig) menghasilkan urutan nukleotida sebanyak 1268 pb dan mengkode asam amino sebanyak 422 pb. Nilai homologi nukleotida dan asam amino tertinggi sebesar 98,5% dan 99,1%. Hasil analisis filogenetika berdasarkan urutan nukleotida dan asam amino menunjukkan isolat HearNPV asal Bogor berada dalam kelompok yang sama dengan NPV yang menyerang genus Helicoverpa dari Brazil, Cina, Belanda, Spanyol, Australia, Jepang, Turki, India. Hasil analisis filogeni berdasarkan asam amino menunjukkan HearNPV Bogor memiliki kekerabatan yang paling dekat dengan HearSNPV asal Australia.