| dc.description.abstract | Ulin (Eusideroxylon zwageri T. et B.), eboni (Diospyros rumphii), dan gaharu
(Aquilaria beccariana) merupakan tiga jenis asli Indonesia yang menurut Redlist
IUCN ketiga jenis ini berstatus kekurangan data dan rawan. Sehingga perlu upaya
untuk melakukan rintisan sekuensing genom pohon dengan MinION Oxford
Nanopore Technology (ONT). Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan data
sekuens whole genome atau sebagian dari E. zwageri, D. rumphii, dan A. beccariana,
kemudian digunakan untuk menganalisis kekerabatan genetik E. zwageri. Prosedur
penelitian mencakup tahapan isolasi DNA dan proses sekuensing hingga analisis
bioinformatika. Hasil menunjukkan bahwa sekuensing DNA E. zwageri, D. rumphii,
dan A. beccariana menghasilkan urutan basa DNA yang terbaca sebesar 305,5 Mb,
3,25 Gb, dan 525,1 Mb dengan genom parsial kloroplas sebesar 109.485 bp,
144.351 bp, dan 157.265 bp. Analisis kekerabatan menunjukkan E. zwageri dengan
menggunakan marka intergenic spacer psbA-trnH berada pada satu clade dengan
genus Eusideroxylon lainnya sedangkan dengan marka trnK, E. zwageri asal
Indonesia mempunyai kedekatan dengan genus Dahlgrenodendron dan
Aspidostemon asal Afrika. | id |
