Potensi Senyawa Aktif Tanaman Obat Antimalaria dengan Target P. falciparum Profilin (PfPfn): Docking dan Simulasi Dinamika Molekul

Abstract

Plasmodium falciparum Profilin (PfPfn) merupakan protein multifungsi yang berperan sebagai pengikat aktin pada tahap invasi sel darah merah, pengikat sekuen prolin, serta berinteraksi dengan polipospoinositida terkait jalur pensinyalan antara membran sel dan sitoskeleton. Simulasi docking dilakukan pada PfPfn dengan 50 senyawa aktif tanaman yang berpotensi sebagai inhibitor PfPfn melalui program Autodock Vina. Simulasi dinamika molekul dilakukan untuk mengetahui kestabilan senyawa yang diuji terhadap PfPfn dengan menggunakan program AMBER18. Hasil simulasi dinamika molekul menunjukkan senyawa strychnopentamine dan liriodenine memiliki potensi sebagai inhibitor dengan rata-rata nilai energi bebas Gibbs sebesar -42.3 kkal mol-1 dan -26 kkal mol-1 dengan kestabilan yang paling baik.