Sekuen Parsial Polimerase DNA HearNPV Untuk Karakterisasi Molekuler.

Abstract

Nucleopolyhedrovirus (NPV) adalah salah satu agens hayati yang digunakan sebagai bioinsektisida untuk mengendalikan ulat penggerek tongkol pada tanaman jagung. HearNPV bersifat spesifik inang, aman bagi lingkungan dan tidak membahayakan mahluk hidup lainnya. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui karakter molekuler dari HearNPV. Sampel ulat diambil dari lapangan kemudian diperbanyak dan diinokulasi di laboratorium. Isolat DNA diekstraksi mengikuti prosedur CTAB yang dimodifikasi. Amplifikasi DNA menggunakan primer forward (5’- GTT TAG GCA AGT GGT GGA CT -3’) dan reverse (5’- TGT AAC TGC AGA TGA CTA CAA AGA -3’). Karakteristik homologi dan filogeni digunakan untuk mengetahui kekerabatan HearNPV isolat Goa dengan NPV dari negara lain yang telah dilaporkan di situs GenBank. Hasil amplifikasi menunjukkan bahwa HearNPV isolat Goa memiliki hubungan kekerabatan yang tinggi dengan NPV yang menyerang genus Helicoverpa yang berasal dari Spanyol, Australia, Brazil, Rusia, dan Jepang dengan nilai persentase homologi nukleotida sebesar 99%.