dc.description.abstract | Tanaman tebu (Saccharum officinarum L.) merupakan salah satu sumber
bahan baku industri gula, karena mampu mengakumulasi hingga lebih dari 25%
(w/w) sukrosa dari berat basah. Pada tanaman tebu, enzim invertase telah banyak
dilaporkan sebagai kunci regulasi dari akumulasi sukrosa pada batang tebu. Untuk
itu, mengontrol aktivitas enzim invertase merupakan aspek yang sangat penting
dalam meningkatkan kandungan sukrosa dalam batang tebu. Penelitian ini
bertujuan untuk mengetahui korelasi aktivitas enzim dengan kandungan sukrosa
pada batang, mengisolasi serta mendapatkan plasmid rekombinan penyandi enzim
invertase dari berbagai varietas tebu yang berbeda dan memprediksi struktur protein
3D enzim invertase dengan pendekatan bioinformatika.
Tahapan penelitian dimulai dari pengambilan sampel tanaman tebu dari PT.
PG. Rajawali II dan PT. Jatitujuh, dilanjutkan dengan isolasi total RNA dan inisiasi
kalus serta penanaman bibit tebu di lahan percobaan. Kalus dan tanaman tebu yang
berumur 6-8 bulan digunakan untuk analisis aktivitas enzim SAI (soluble acid
invertase) serta isolasi total RNA dan sintesis cDNA. cDNA digunakan sebagai
template amplifikasi gen invertase dengan teknik PCR (Polymerase chain
reaction), dilanjutkan dengan ligasi ke dalam vektor pTA2 dan transformasi ke
Escherichia coli DH5α. Koloni positif dikonfirmasi dengan teknik PCR colony.
Analisis sekuen gen penyandi invertase dengan teknik bioinformatika untuk
memprediksi sisi aktif pada struktur protein 3D.
Persentase pembentukan kalus tertinggi terjadi pada varietas KK (94.70%),
diikuti oleh PS 862 (80.33%) dan BL (65.25%). Data hasil uji korelasi
menunjukkan nilai R (-0.826), diketahui bahwa aktivitas enzim soluble acid
invertase dengan rendemen tebu berhubungan negatif mendekati sempurna. Artinya
semakin tinggi aktivitas enzim maka nilai rendemen tebu yang dihasilkan akan
semakin rendah. Produk PCR gen Invertase berukuran 1800 bp yang menyandikan
residu asam amino berjumlah 574 telah berhasil diperoleh. Hasil analisis sekuen
asam amino dari gen invertase yang diperoleh memiliki nilai Identity 99% dengan
asam amino penyusun cell wall invertase dari Saccharum hybrid cultivar FN-41
clone INV12. Hasil analisis motif gene pada sekuen asam amino menggunakan
perangkat lunak Genious R 10, menunjukkan terdapat motif asam amino lestari
pada residu asam amino ke Asn76(asparagin), Asp77(asam aspartat), Pro78(prolin),
Gly80(Glysin), dan Arg165(arginin) | id |