Pencirian bakteri penghasil protease yang diisolasi dari limbah cair tahu dengan bantuan pulsed-field gel electrophoresis

Abstract

Tiga isolat bakteri penghasil protease yaitu Y1, Y2 dan Y3 telah berhasil diisolasi dari limbah cair tahu. Ketiga isolat tersebut tumbuh dengan baik pada media Nutrient Agar dan media yang mengandung 150 mg/l siklohek- simid, tetapi tidak tumbuh pada media yang mengandung 20 mg/ml eritromisin. Identifikasi genus bakteri berda- sarkan Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, edisi ke-8 (1974) menunjukkan bahwa ketiga isolat termasuk dalam genus Bacillus yang resisten terhadap 50 µg/ml ampisilin. Identifikasi spesies bakteri menunjukkan bahwa ketiga bakteri adalah Bacillus pumilus. Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) digunakan untuk melakukan pencirian sidik jari DNA menggunakan enzim restriksi BglI, Xhol dan Apal. Analisis PFGE menunjukkan bahwa skisotipe bakteri Y3 sama dengan skisotipe B. pumilus sedangkan skisotipe bakteri Y₁ identik dengan skisotipe Y2 tetapi berbeda dengan skisotipe B. pumilus. Hasil penelitian ini menun- jukkan bahwa analisis sidik jari DNA dengan PFGE dapat membedakan galur B. pumilus yang morfologi dan fisiologi- nya nampak sama.