Isolasi DNA dari lingkungan dan studi transformasi, Bacillus subtilis DB104

Abstract

Aplikasi enzim di bidang bioteknologi semakin menuntut adanya enzim- enzim yang memiliki stabilitas tinggi terhadap lingkungan ekstrim, seperti pada temperatur tinggi, pH ekstrim dan kandungan logam tinggi. Dari sekian banyak mikroba ekstrim penghasil enzim yang memiliki nilai ekonomi tinggi, terdapat keterbatasan dalam mengkulturkannya, sehingga sulit untuk memproduksi enzim. Saat ini telah berkembang teknik produksi enzim secara molekular, yaitu dengan memilah gen penyandi enzim dari DNA total asal lingkungan, mengklonkan ke inang yang sesuai dan mengekspresikannya. Isolasi langsung DNA total telah memungkinkan untuk memperoleh gen-gen penting dari berbagai mikroorganisme yang terdapat di lingkungan. Penelitian ini bertujuan (1) mengkoleksi isolat DNA dari berbagai lingkungan dengan kondisi ekstrim yang dapat digunakan untuk penelitian lanjut di bidang bioteknologi dan (2) mempelajari transformasi Bacillus subtilis DB104. Penelitian didahului dengan pengambilan sampel dari berbagai lokasi yang dinilai potensial mengandung mikroba-mikroba ekstrim. Koleksi sampel tersebut adalah Sumber Air Panas Cimanggu-Ciwidey, kawah Gunung Tangkuban Perahu, kali Sunter, sungai Ciliwung, dan tempat pembuangan sampah Jatinegara. Dari koleksi sampel ini didapatkan sepuluh situs terbaik yang dipersiapkan untuk tahapan isolasi DNA langsung.