Identifikasi Molekuler, Struktur dan Keragaman Genetik Karang Lunak Clavularia inflata Antar Tiga Populasi di Perairan Banten, Jakarta dan Natuna

Abstract

Clavularia inflata adalah spesies karang lunak yang dapat ditemukan di perairan Indonesia. Distribusi dan habitat Clavularia inflata di Indonesia masih belum banyak diketahui, karena penelitian mengenai karang lunak tersebut masih tidak banyak dilakukan. Metode taksonomi molekuler merupakan suatu metode untuk mengidentifikasi spesies dan mengetahui struktur populasi dan keragaman genetik. Untuk itulah penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk mengidentifikasi molekuler dan mengetahui struktur serta keragaman genetik populasi karang lunak Clavularia inflata diperairan Tanjung Lesung-Banten, Pulau Panjang-Kepulauan Seribu dan Natuna-Kepulauan Riau. Sebanyak 22 sampel jaringan dari ketiga lokasi penelitian teranalisis dan teridentifikasi sebagai Clavularia inflata dengan nilai BLAST berkisar 98-100 %. Proses untuk menganalisis pada penelitian ini terdapat ekstraksi, amplifikasi DNA, elektroforesis, dan sekuensing DNA. Hasil struktur genetik menunjukkan bahwa ketiga populasi secara signifikan memiliki variasi antar individu yang tinggi dengan nilai Fst = 0,737 dan P<0,05. Nilai keragaman genetik yang didapatkan secara keseluruhan memiliki nilai Hd dengan nilai sekitar 0.95-1 dari populasi perairan Pulau Panjang dan Tanjung Lesung. Jarak genetik dengan jarak geografis di antara populasi dapat mengindikasikan bahwa isolasi geografis memiliki peranan penting dalam penentuan perbedaan genetik antar populasi.