Identifikasi Molekuler, Struktur dan Keragaman Genetik Karang Lunak Clavularia inflata Antar Tiga Populasi di Perairan Banten, Jakarta dan Natuna
View/ Open
Date
2017Author
Izza, Luzmi Malia
Bengen, Dietriech Goffrey
Madduppa, Hawis H
Metadata
Show full item recordAbstract
Clavularia inflata adalah spesies karang lunak yang dapat ditemukan di
perairan Indonesia. Distribusi dan habitat Clavularia inflata di Indonesia masih
belum banyak diketahui, karena penelitian mengenai karang lunak tersebut masih
tidak banyak dilakukan. Metode taksonomi molekuler merupakan suatu metode
untuk mengidentifikasi spesies dan mengetahui struktur populasi dan keragaman
genetik. Untuk itulah penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk
mengidentifikasi molekuler dan mengetahui struktur serta keragaman genetik
populasi karang lunak Clavularia inflata diperairan Tanjung Lesung-Banten,
Pulau Panjang-Kepulauan Seribu dan Natuna-Kepulauan Riau. Sebanyak 22
sampel jaringan dari ketiga lokasi penelitian teranalisis dan teridentifikasi sebagai
Clavularia inflata dengan nilai BLAST berkisar 98-100 %. Proses untuk
menganalisis pada penelitian ini terdapat ekstraksi, amplifikasi DNA,
elektroforesis, dan sekuensing DNA. Hasil struktur genetik menunjukkan bahwa
ketiga populasi secara signifikan memiliki variasi antar individu yang tinggi
dengan nilai Fst = 0,737 dan P<0,05. Nilai keragaman genetik yang didapatkan
secara keseluruhan memiliki nilai Hd dengan nilai sekitar 0.95-1 dari populasi
perairan Pulau Panjang dan Tanjung Lesung. Jarak genetik dengan jarak geografis
di antara populasi dapat mengindikasikan bahwa isolasi geografis memiliki
peranan penting dalam penentuan perbedaan genetik antar populasi.