Please use this identifier to cite or link to this item:
http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/47171
Title: | Cytochrome oxidase subunit 1 (COI) gene variations in mitochondrial DNA of Apis koschevnikovi in South Kalimantan |
Authors: | Raffiudin, Rika Mochamad, Chandra W. Dzulfaqor |
Keywords: | DNA barkode COI A. koschevnikovi DNA mitokondria haplotipe Bogor Agricultural University (IPB) |
Issue Date: | 2011 |
Publisher: | IPB (Bogor Agricultural University) |
Abstract: | Deforestasi di hutan Kalimantan yang berupa pembalakan dan konversi hutan menjadi perkebunan kelapa sawit menghancurkan habitat organisme dan ekosistem. Kondisi ini merupakan ancaman yang serius terhadap spesies asli yang berasal dari Kalimantan, termasuk Apis koschevnikovi (Hymenoptera; Apidae). Penelitian-penelitian sebelumnya menunjukkan kecendrungan populasi A. koschevnikovi yang terus menurun. Memelihara integritas ekologi A. koschevnikovi sangat diperlukan, termasuk database molekulernya. Sitokrom Oksidase subunit I (COI) di DNA mitokondria (DNAmt) dapat membantu dengan menyediakan penanda molekuler dengan teknologi berbasis DNA barcoding. Saat ini, telah ditemukan sebanyak 15 jenis haplotipe gen COI dari A. koschevnikovi yang telah dipublikasikan di Genbank. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui variasi genetik dari A. koschevnikovi Kalimantan Selatan berdasarkan gen COI dengan menggunakan metode sekuensing DNA. Contoh yang digunakan dalam penelitian ini berasal dari 5 kabupaten di Kalimantan Selatan; Hulu Sungai Selatan (HSS), Hulu Sungai Tengah (HST), Kotabaru (KB), Tanah Bumbu (TB), and Balangan (BL). Pengurutan nukleotida dari contoh yang digunakan menghasilkan panjang nukleotida sebanyak 738 bp, dan sebanyak 5 haplotipe dari nukleotida telah ditemukan. Haplotipe umum ditemukan dari contoh yang berasal dari Kabupaten HST dan TB. Hasil pengurutan dari contoh ini tidak menunjukkan kesamaan dengan 15 haplotipe dari Genebank, sehingga 5 haplotipe yang ditemukan dalam penelitian ini dapat disimpulkan sebagai haplotipe baru |
URI: | http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/47171 |
Appears in Collections: | UT - Biology |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
G11dzu.pdf Restricted Access | fulltext | 708.2 kB | Adobe PDF | View/Open |
G11dzu_Cover.pdf Restricted Access | Cover | 280.34 kB | Adobe PDF | View/Open |
G11dzu_Abstract.pdf Restricted Access | Abstract | 274.07 kB | Adobe PDF | View/Open |
G11dzu_BAB I Pendahuluan.pdf Restricted Access | BAB I | 284.52 kB | Adobe PDF | View/Open |
G11dzu_BAB II Materials and Methods.pdf Restricted Access | BAB II | 345.9 kB | Adobe PDF | View/Open |
G11dzu_BAB III Hasil.pdf Restricted Access | BAB III | 363.58 kB | Adobe PDF | View/Open |
G11dzu_Kesimpulan.pdf Restricted Access | Kesimpulan | 296.88 kB | Adobe PDF | View/Open |
G11dzu_Daftar Pustaka.pdf Restricted Access | Daftar Pustaka | 300.21 kB | Adobe PDF | View/Open |
G11dzu_Lampiran.pdf Restricted Access | Lampiran | 563.2 kB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.