Please use this identifier to cite or link to this item: http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/166934
Title: PROFIL METAGENOM BAKTERI TANAH PADA EKOSISTEM SABANA TAMAN NASIONAL RAWA AOPA WATUMOHAI, SULAWESI TENGGARA
Other Titles: 
Authors: Nurcholis, Waras
Pratama, Rahadian
Achyar, Catellia Auliany
Issue Date: 2025
Publisher: IPB University
Abstract: Taman Nasional Rawa Aopa Watumohai (TNRAW) di Sulawesi Tenggara merupakan kawasan konservasi dengan keanekaragaman hayati unik, termasuk mikroba tanah yang beradaptasi dengan ekosistem sabana bercurah hujan rendah dan suhu tinggi. Penelitian ini bertujuan mengeksplorasi profil metagenom komunitas bakteri tanah di ekosistem sabana TNRAW serta gen fungsional yang dimiliki. Metode yang digunakan meliputi pengambilan sampel tanah dari lima titik, ekstraksi DNA, serta evaluasi kualitas hasil ekstraksi DNA. Sekuensing dilakukan dengan Oxford Nanopore Technologies PromethION 2 Solo, sedangkan analisis data menggunakan platform UseGalaxy dan R. Sekuensing seluruh sampel menghasilkan 262.582 sekuens dengan 69.330.718 bacaan. Keragaman bakteri pada seluruh sampel tanah sabana sangat tinggi dengan genus dominan antara lain Photobacterium, Vibrio, Escherichia, dan Streptomyces, serta dominasi famili Vibrionaceae dan Enterobacteriaceae. Analisis NMDS dan heatmap mengungkap perbedaan signifikan komposisi komunitas bakteri antar lokasi. Penelitian ini menunjukkan bahwa ekosistem sabana TNRAW menyimpan potensi mikrobioma tanah yang tinggi dan dapat dimanfaatkan dalam riset dan industri bioteknologi.
URI: http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/166934
Appears in Collections:UT - Biochemistry

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
cover_G8401211088_26db5dbeb77240bdb45a602368b125c1.pdfCover7.75 MBAdobe PDFView/Open
fulltext_G8401211088_0423ad85cbbb46b488c907960464d82e.pdf
  Restricted Access
Fulltext1.24 MBAdobe PDFView/Open
lampiran_G8401211088_5928b9c2bfa14965b4473af68460a819.pdf
  Restricted Access
Lampiran8.3 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.