PROFIL METAGENOM BAKTERI TANAH PADA EKOSISTEM SABANA TAMAN NASIONAL RAWA AOPA WATUMOHAI, SULAWESI TENGGARA
Date
2025Author
Achyar, Catellia Auliany
Nurcholis, Waras
Pratama, Rahadian
Metadata
Show full item recordAbstract
Taman Nasional Rawa Aopa Watumohai (TNRAW) di Sulawesi Tenggara merupakan kawasan konservasi dengan keanekaragaman hayati unik, termasuk mikroba tanah yang beradaptasi dengan ekosistem sabana bercurah hujan rendah dan suhu tinggi. Penelitian ini bertujuan mengeksplorasi profil metagenom komunitas bakteri tanah di ekosistem sabana TNRAW serta gen fungsional yang dimiliki. Metode yang digunakan meliputi pengambilan sampel tanah dari lima titik, ekstraksi DNA, serta evaluasi kualitas hasil ekstraksi DNA. Sekuensing dilakukan dengan Oxford Nanopore Technologies PromethION 2 Solo, sedangkan analisis data menggunakan platform UseGalaxy dan R. Sekuensing seluruh sampel menghasilkan 262.582 sekuens dengan 69.330.718 bacaan. Keragaman bakteri pada seluruh sampel tanah sabana sangat tinggi dengan genus dominan antara lain Photobacterium, Vibrio, Escherichia, dan Streptomyces, serta dominasi famili Vibrionaceae dan Enterobacteriaceae. Analisis NMDS dan heatmap mengungkap perbedaan signifikan komposisi komunitas bakteri antar lokasi. Penelitian ini menunjukkan bahwa ekosistem sabana TNRAW menyimpan potensi mikrobioma tanah yang tinggi dan dapat dimanfaatkan dalam riset dan industri bioteknologi.
Collections
- UT - Biochemistry [1466]
