View Item 
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Mathematics and Natural Sciences
      • UT - Biochemistry
      • View Item
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Mathematics and Natural Sciences
      • UT - Biochemistry
      • View Item
      JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

      PROFIL METAGENOM BAKTERI TANAH PADA EKOSISTEM SABANA TAMAN NASIONAL RAWA AOPA WATUMOHAI, SULAWESI TENGGARA

      Thumbnail
      View/Open
      Cover (7.564Mb)
      Fulltext (1.215Mb)
      Lampiran (8.105Mb)
      Date
      2025
      Author
      Achyar, Catellia Auliany
      Nurcholis, Waras
      Pratama, Rahadian
      Metadata
      Show full item record
      Abstract
      Taman Nasional Rawa Aopa Watumohai (TNRAW) di Sulawesi Tenggara merupakan kawasan konservasi dengan keanekaragaman hayati unik, termasuk mikroba tanah yang beradaptasi dengan ekosistem sabana bercurah hujan rendah dan suhu tinggi. Penelitian ini bertujuan mengeksplorasi profil metagenom komunitas bakteri tanah di ekosistem sabana TNRAW serta gen fungsional yang dimiliki. Metode yang digunakan meliputi pengambilan sampel tanah dari lima titik, ekstraksi DNA, serta evaluasi kualitas hasil ekstraksi DNA. Sekuensing dilakukan dengan Oxford Nanopore Technologies PromethION 2 Solo, sedangkan analisis data menggunakan platform UseGalaxy dan R. Sekuensing seluruh sampel menghasilkan 262.582 sekuens dengan 69.330.718 bacaan. Keragaman bakteri pada seluruh sampel tanah sabana sangat tinggi dengan genus dominan antara lain Photobacterium, Vibrio, Escherichia, dan Streptomyces, serta dominasi famili Vibrionaceae dan Enterobacteriaceae. Analisis NMDS dan heatmap mengungkap perbedaan signifikan komposisi komunitas bakteri antar lokasi. Penelitian ini menunjukkan bahwa ekosistem sabana TNRAW menyimpan potensi mikrobioma tanah yang tinggi dan dapat dimanfaatkan dalam riset dan industri bioteknologi.
      URI
      http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/166934
      Collections
      • UT - Biochemistry [1466]

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository
        

       

      Browse

      All of IPB RepositoryCollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

      My Account

      Login

      Application

      google store

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository