Please use this identifier to cite or link to this item:
http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/137989
Title: | Analisis Long-Read Sequences DNA Jenis Merbau (Intsia bijuga), Cendana (Santalum album), dan Kelor (Moringa oleifera) |
Other Titles: | Analysis of Long-Read Sequences DNA on Merbau (Intsia bijuga), Sandalwood (Santalum album), and Moringa (Moringa oleifera) |
Authors: | Siregar, Iskandar Zulkarnaen Pratama, Rahadian Aryana, Ayundra Maharani Manitya |
Issue Date: | 2024 |
Publisher: | IPB University |
Abstract: | Informasi genetik dapat digunakan dalam upaya konservasi dengan menduga keragaman genetik melalui penggunaan marka genetik. Sekuens DNA dapat diperoleh melalui tahap ekstraksi, isolasi, dan sekuensing. Sekuensing dapat dilakukan menggunakan mesin dengan teknologi terbaru seperti teknologi ONT, namun jarang sekali diaplikasikan pada pohon hutan. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan sekuens DNA dan melakukan analisis filogenetik beberapa jenis pohon hutan, yaitu merbau (Intsia bijuga), cendana (Santalum album), dan kelor (Moringa oleifera). Tahapan penelitian mencakup perolehan data hasil sekuensing dan basecalling, quality check, assembly, polishing, anotasi, analisis kekerabatan, serta konstruksi pohon filogenetik. Analisis kekerabatan dilakukan menggunakan DNA sekuens berupa intergenic spacer trnH-psbA, accD, dan matK. Hasil analisis kekerabatan menunjukkan bahwa pohon filogenetik jenis merbau, cendana, dan kelor memiliki nilai bootstrap yang bervariasi yaitu masing-masing sebesar 0,965 (96,5%), 0,509 (50,9%), dan 0,798 (79,8%). |
URI: | http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/137989 |
Appears in Collections: | UT - Silviculture |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
Cover, Lembar Pengesahan, Prakata, Daftar Isi.pdf Restricted Access | Cover | 1.72 MB | Adobe PDF | View/Open |
E44190043_Ayundra Maharani MA.pdf Restricted Access | Fullteks | 4.81 MB | Adobe PDF | View/Open |
Lampiran.pdf Restricted Access | Lampiran | 574.56 kB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.