Pemanfaatan Gen Pengkode odc dan ldc untuk Deteksi Dini Pembentukan Putresin dan Kadaverin pada Ikan Scombridae

Abstract

Putresin dan kadaverin merupakan jenis biogenik amin yang terbentuk melalui proses dekarboksilasi asam amino, yaitu ornitin dan lisina dengan enzim yang terlibat adalah ornitin dekarboksilase dan lisin dekarboksilase. Gen pengkode enzim tersebut dapat dimanfaatkan dalam metode pendeteksi dini secara molekuler, yaitu pada mikroorganisme pembentuk putresin dan kadaverin. Pada penelitian ini, pendeteksian tersebut dilakukan melalui tahap pre-enrichment dan non preenrichment mikroba yang terdapat pada sampel, isolasi DNA bakteri menggunakan TianGen DNA kit dan CTAB 2%, amplifikasi DNA menggunakan primer spesifik PUT1 dan CAD1 serta primer universal 16S rRNA. DNA bakteri yang terdapat pada ikan scombroid dengan metode pre-enrichment berhasil diisolasi. Gen ldc berhasil diamplifikasi dengan primer CAD1 pada ukuran 1 098 bp. Isolat bakteri secara umum juga berhasil diamplifikasi dengan primer 16S rRNA pada ukuran 1 500 bp. Jenis bakteri pengkode gen ldc yang terdeteksi berasal dari famili Enterobacteriaceae dimana spesies Enterobacter chengduensis memiliki kesamaan dengan bakteri pada ikan tuna, dan Enterobacter roggenkampii memiliki kesamaan dengan bakteri pada ikan tongkol dan cakalang.