Identifikasi gen potensial toleran Ai pada padi dengan pendekatan Microcolinearity

Abstract

Padi (Oryza sativa L) merupakan anggota Graminae yang paling toleran terhadap cekaman Aluminium (Al). Akan tetapi mekanisme toleransi dan gen-gen yang terlibat dalam mekanisme toleransi tersebut belum diketahui. Penelitian ini berusaha untuk mengidentifikasi gen potensial toleran Al pada padi dengan pendekatan microcolinearity antara gen-gen pada kromosom padi dan rye (Secale cereale L). Teknik reverse Transcripatase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) digunakan untuk menganalisis ekspresi dari gen-gen tersebut. Hasil penelitian menunjukan bahwa dari 16 kandidat gen yang dianalisis terdapat satu gen (B16) yang ekspresinya di-downregulated ole cekaman Al dan satu gen (B11) yang ekspresinya di-upregulated oleh cekaman Al. Analisis sekuen menunjukan bahwa gen B16 adalah gen thioredoxin yang berperan dalam mekanisme pertahanan terhadap cekaman, sedangkan gen B11 merupakan gen baru yang belum memiliki fungsi tetapi diekspresikan secara berlebih pada akar padi var. Hawarbunar yang toleran Al selama mengalami cekaman Al. Gen B11 ini merupakan kandidat gen toleran Al pada padi dan akan dianalisis lebih lanjut.