Perbandingan pembangunan phylogenetic tree menggunakan algoritma unweighted pair group method with arithmatic mean dan algoritma neighbor joining

Abstract

Untuk mengetahui bagaimana proses evolusi maupun mengetahui hubungan evolusi antar organisme terjadi merupakan tantangan yang dirasakan amat penting oleh para ahli biologi. Bidang kajian ilmu yang mempelajari hubungan evolusi antar organisme disebut phylogenetics. Analisis phylogenetic memiliki artian menduga atau memperkirakan bagaimana hubungan evolusi itu terjadi. Secara umum analisis phylogenetic terdiri dari empat langkah utama, yaitu pencocokan, menentukan model substitusi, membangun phylogenetic tree dan evaluasi terhadap tree. Metode yang digunakan untuk membangun phylogenetic tree dapat dikelompokkan menjadi dua, yaitu metode yang berdasarkan jarak (distance-based) dan berdasarkan karakter (character-based).