Isolasi dan Karakterisasi Sekuen Parsial Gen Penyandi Glucose Transporter 1 pada Ikan Gurami Osphronemus goramy

Abstract

Ikan gurami merupakan ikan herbivora asli Indonesia dan mampu memanfaatkan karbohidrat dengan baik. Evaluasi terhadap kemampuan pencernaan karbohidrat pada ikan dapat dilakukan dengan memanfaatkan gen-gen yang berperan dalam proses metabolisme karbohidrat. Glucose transporter 1 merupakan salah satu gen yang berperan aktif dalam proses metabolisme karbohidrat pada ikan. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengisolasi dan mengkarakterisasi sekuen gen penyandi glucose transporter 1 dari ikan gurami Osphronemus goramy. Isolasi gen glucose transporter 1 dilakukan pada cDNA yang berasal dari organ hati. Hasil isolasi sekuen parsial gen glucose transporter 1 pada ikan gurami, diperoleh susunan nukleotida yang diperoleh sepanjang 434 bp. Analisis basa nukleotida dengan fasilitas BLAST® pada NCBI menunjukkan susunan nukleotida gen glucose transporter 1 ikan gurami memiliki kesamaan yang tinggi dengan gen glucose transporter 1 ikan kerapu muara Amphiprion ocellaris (91%) dan ikan mas Cyprinus carpio (85%). Pada susunan asam amino, gen glucose transporter 1 ikan gurami memiliki kesamaan yang tinggi dengan ikan kerapu muara Epinephelus coioides (95%) dan ikan zebra Danio rerio (90%). Analisis domain protein dilakukan untuk menunjukkan domain protein khas pada sekuen gen glucose transporter 1 ikan gurami. Hasil analisis menunjukkan adanya famili dari domain major facilitator superfamily (MFS) pada susunan nukleotida yang diperoleh, yaitu sugar transporter. Analisis pohon filogenetik terhadap gen glucose transporter 1 ikan gurami diperoleh bahwa jarak genetik gen glucose transporter 1 ikan gurami dari spesies ikan lainnya bernilai 0,0180.