Variasi Gen Pengkode Subunit E1β Branched-Chain α- Keto Acid Dehydrogenase Complex Pada Kambing Kacang Dan Kosta
View/ Open
Date
2017Author
Pratama, Esa Ayu
Farajallah, Achmad
Astuti, Dewi Apri
Metadata
Show full item recordAbstract
Kompleks branched-chain α-keto acid dehydrogenase (BCKDH)
merupakan kompleks multi enzim yang memiliki peran penting dalam regulasi
katabolisme asam amino bercabang (branched-chain amino acids, BCAA).
Informasi mengenai gen BCKDH telah dilaporkan pada sapi, sedangkan pada
ruminansia kecil seperti kambing dan domba hingga saat ini belum ada laporan.
Tujuan dari penelitian ini adalah memetakan variasi ekson 1, 3, dan 4 dari gen
pengkode subunit E1β branched-chain α-ketoacid dehydrogenase complex
(BCKDHB) pada kambing kacang (n=2) dan kosta (n=2) jantan.
Proses amplifikasi DNA dengan teknik PCR menggunakan pasangan
primer AF515-AF516, AF519-AF520, dan AF521-AF522 adalah sekuen ekson 1
(64 bp), ekson 3 (134 pb), dan ekson 4 (156 pb) yang conserved pada keempat
sekuen yang dianalisis. Situs yang bervariasi terdapat pada daerah 5’UTR (C10G
dan A11C), intron 1 (G199C, C302T, C461T, C538T, dan C583T), dan intron 4
(T553C dan A758G). Penyejajaran hasil deduksi asam amino menunjukkan
bahwa keempat sekuen kambing identik dengan sekuen asam amino dari kambing
hitam Yunnan yang telah dipublikasikan di GenBank (XM_005684454 dan
NC_022301). Hal ini menunjukkan bahwa variasi nukleotida yang terdapat pada
intron 1 dan 4 merupakan mutasi netral.