Analisis Molekuler Latar Belakang Genetik Galur-Galur Harapan Padi Ciherang Aromatik (BC5F6)

Abstract

Padi aromatik lokal Pandan Wangi dan Mentik Wangi telah dikembangkan sebagai tetua donor dalam pembentukkan varietas unggul padi aromatik dengan padi Ciherang sebagai tetua pemulih nonaromatik yang memiliki karakterisasi unggul. Penelitian ini bertujuan menganalisis persentase genome recovery tetua pemulih dari dua set populasi backcross (BC5F6) melalui seleksi background genetik dengan bantuan marka molekuler. DNA padi tetua dan galur BC5F6 berhasil diisolasi dan diamplifikasi dengan primer polimorfik terpilih hasil survei primer. Persentase pemulihan genom alel Ciherang pada galur BC5F6 populasi Ciherang-Pandan Wangi mencapai 98.95% pada semua kedelapan individu, kecuali individu nomor 4, 7, dan 8 yang masing-masing bernilai 86.92%, 96.99%, dan 97.91%. Persentase pemulihan genom tiap sembilan individu galur BC5F6 populasi Ciherang-Mentik Wangi seragam sebesar 80%. Visualisasi data juga dilakukan menggunakan perangkat lunak Graphical Genotypes (GGT) versi 2.0.