Penguraian Mekanisme Kerja Jamu Berdasarkan Jejaring Bahan Aktif-Ptotein Target-Gene Ontology(Studi Kasus : Diabetes Tipe 2)

Abstract

Jamu merupakan obat tradisional Indonesia. Pada dasarnya obat herbal yang dibuat dari bahan-bahan alami yang diambil dari beberapa bagian dari tanaman obat yang mengandung beberapa zat dan senyawa yang penting dan bermanfaat bagi tubuh. Khasiat untuk beberapa jenis jamu secara empiris telah terbukti. Peneitian ini bermaksud untuk menguraikan mekanisme kerja jamu menggunakan pendekatan komputasi. Penelitian ini berfokus pada ramuan jamu diabetes tipe 2 yang terdiri atas empat tanaman, diantaranya adalah: jahe, bratawali, sembung, dan pare. Kerangka analisis awal membentuk 3 komponen jejaring yang terdiri atas: (1) bahan aktif tanaman (diperoleh dari Knapsack : 58), (2) protein target (diperoleh dari database pubchem : 416), dan ( 3) gen ontology atau GO (diperoleh dari database DAVID : 3104). Selanjutnya, dilakukan analisis gerombol dengan menggunakan konsep graf tri-partite. Graf tri- partite digunakan untuk mengelompokkan komponen-komponen penyusun jejaring dari empat tanaman tersebut, sehingga diperoleh sistem bagian-bagian penyusun ramuan jamu. Hal ini dilakukan untuk mengungkapkan mekanisme kerja jamu. Menggunakan metode penggerombolanfuzzy pada data jejaring, diperoleh 15 senyawa aktif yang diduga potensial sebagai antidiabetes berada dalam kelompok berbeda. 15 senyawa aktif memiliki nilai peluang cukup tinggi terbagi dalam kelompok yang berbeda.Setiap kelompok terdiri atas pasangan bahan aktif yang memiliki efek sinergis tinggi. Berdasarkan koneksi antara gerombol protein dan GO, diperoleh informasi protein-protein yang menyebabkan diabetes tipe 2 dan mekanisme proses biologis yang terkait. Diabetes tipe 2 bukan hanya disebabkan oleh protein kelainan sekresi insulin (insulin-merendahkan enzim isoform 1) saja, tetapi juga disebabkan oleh protein lain yang terlibat dalam penghambatan insulin di pankreas. Hasil penggerombolan fuzzy pada GO diperoleh proses biologi yang terlibat dalam peningkatan dan penurunan regulasi. Hasil yang lebih dominan menunjukkan gen-gen yang terlibat dalam proses biologi penurunan regulasi diabetes tipe 2. Secara medispenurunan regulasi yang signifikan menyebabkan fungsi organ menurun dan mengalami resistensi insulin, sehingga mengakibatkan timbulnya penyakit diabetes tipe 2. Kata