Identifikasi Trichoderma sp. Melalui Sekuen Internal Transcribed Spacer (ITS) dan Uji Inhibisinya terhadap Colletotrichum sp. dan Rhizoctonia sp.

Abstract

Rhizoctonia sp. dan Colletotrichum sp. merupakan patogen yang banyak menyerang tanaman. Penggunaan agen biokontrol dalam melawan patogen tanaman menjadi salah satu alternatif terhadap penggunaan pestisida sintetik. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi Trichoderma sp. secara morfologi dan molekuler serta menyeleksi isolat Trichoderma sp. yang memiliki penghambatan terbesar terhadap patogen secara in vitro. Metode identifikasi dilakukan dengan mikroskop cahaya dan amplifikasi daerah Internal Transcribed Spacer (ITS) sedangkan seleksi dilakukan dengan metode uji berganda secara bertahap. Secara umum, Trichoderma sp. memiliki permukaan rata, tepian regular, berwarna kuning sampai hijau, serta konidiofor bercabang. DNA hasil amplifikasi menggunakan primer ITS1 dan ITS4 berukuran 600-700 bp. Hasil identifikasi dari 17 isolat didapatkan sebanyak 13 isolat merupakan Trichoderma asperellum, 1 isolat Trichoderma gamsii, 1 isolat Trichoderma koningiopsis, dan 2 sisanya Trichoderma harzianum. Nilai penghambatan > 80% yang lebih banyak menunjukkan isolat Trichoderma sp. lebih berpotensi menghambat Rhizoctonia sp. dibandingkan Colletotrichum sp.