Marka Molekuler untuk Gen Ketahanan Penyakit Blas (Piz dan Piz-t) pada Beberapa Varietas Padi Gogo

Abstract

Salah satu kendala utama dalam peningkatan produksi padi gogo adalah penyakit blas yang diinfeksi oleh cendawan Pyricularia oryzae, penyebab biji hampa. Peningkatan sifat ketahanan terhadap blas dilakukan melalui persilangan antara padi gogo varietas Way Rarem dengan varietas padi gogo asal Kolombia, Oryzica Llanos-5 yang diduga memiliki beberapa gen Pi sebagai gen tahan blas. Penelitian ini bertujuan memperoleh marka molekuler yang spesifik untuk mendeteksi gen Piz dan Piz-t pada tetua Way Rarem dan Oryzica Llanos-5. Hasil isolasi tujuh tanaman sampel dan kontrol rentan dari beberapa varietas padi gogo diamplifikasi menggunakan primer z56592, zt5659, AP5659-1, AP5659-3 dan AP5659-5 melalui teknik PCR, kemudian dielektroforesis dengan metode silver staining. Elektroforegram menunjukkan pola pita DNA yang tidak sesuai untuk primer z56592, zt5659, AP5659-1, dan AP5659-5 sementara primer AP5659-3 menjadi primer yang spesifik karena memberikan pola pita DNA yang polimorfis. Hasil deteksi dengan primer AP5659-3 menunjukkan bahwa Oryzica Llanos-5 dan Way Rarem mengandung gen Piz-t yang berada pada ukuran alel sekitar 200 bp, sedangkan Kencana Bali, Cirata, dan Situ Bagendit merupakan tanaman rentan yang tidak mengandung gen Piz maupun Piz-t. Dengan demikian, dapat disimpulkan bahwa primer AP5659-3 merupakan marka molekuler yang dapat mendeteksi gen Piz dan Piz-t.