Identifikasi dan laju konsumsi metana Bakteri Metanotrof dari lahan sawah Indramayu dan Surabaya

Abstract

Metana merupakan salah satu gas rumah kaca yang menyebabkan pemanasan global. Bakteri metanotrof memanfaatkan metana sebagai sumber karbon dan energi. Penelitian ini bertujuan mengisolasi bakteri metanotrof dan mengidentifikasi gen pengoksidasi gas metana. Tujuh isolat bakteri metanotrof (IM1, IM2, IM5, SB2, SB3, SB4, dan SB5) diisolasi dari tanah sawah melalui teknik pengayaan dengan media NMS (nitrate mineral salts). Pengukuran laju konsumsi metana dilakukan dengan kromatografi gas. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ketujuh isolat mampu mengoksidasi gas metana. Laju konsumsi metana tertinggi dimiliki isolat SB3. Identifikasi gen yang mengkode enzim metana monooksigenase (pmoA) menggunakan primer yaitu A189f - mb661r menunjukkan IM2, IM5, SB2, SB3, SB4 dan SB5 memiliki gen pmoA. Hasil perunutan DNA gen pmoA dan analisis blast menunjukkan dua isolat masuk ke dalam genus Methylocystis dan empat isolat masuk ke dalam genus Mesthylosinus. Kedua gen tersebut masuk dalam kelompok metanotrof tipe II yang menggunakan jalur serin untuk mengoksidasi metana.