Analisis profil DNA genom sejumlah isolat Xanthomonas campestris pv. glycines dengan menggunakan elektrophoresis gel Medan berpulsa (pulsed-field gel electrophoresis)

Abstract

Penyakit bisul bakteri merupakan salah satu dari tiga penyakit bakterial pada tanaman kedelai di Indonesia yang belum dapat ditanggulangi dengan baik, sehingga menjadi salah satu sebab utama rendahnya produksi kedelai di Indonesia. Schizotyping merupakan salah satu metode analisis profil DNA dengan menggunakan Pulsed-Field Gel Electrophoresis. Analisis profil DNA genom Xanthomonas campestris pv. glycines merupakan langkah awal untuk memahami mekanisme patogenesis secara molekuler, dan untuk studi epidemiologi penyakit bisul bakteri pada kedelai. Penelitian ini dilakukan dengan tujuan: (i) mengisolasi dan mengkoleksi Xanthomonas campestris pv. glycines dari berbagai daerah pertanaman kedelai di pulau Jawa, (ii) menelaah schizotipe masing-masing isolat, dan (iii) melakukan analisis hubungan kekerabatan dan filogenetik dari isolat-isolat yang terkumpul...dst