Karakterisasi morfologi dan variasi gen COI dan COII DNA mitokondria Genus Etiella, Scirpophaga, dan Ostrinia (Lepidoptera: Superfamili Pyraloidea)

Abstract

Pyraloidea, salah satu superfamili dari Ordo Lepidoptera terdiri dari Famili Pyralidae dan Crambidae. Sebagian besar serangga dalam Superfamili Pyraloidea merupakan serangga penggerek tanaman pertanian. Serangga penggerek Etiella zinckenella (Pyralidae: Phycitinae) dikenal sebagai penggerek polong kedelai. Ostrinia furnacalis (Crambidae: Pyraustinae) sebagai penggerek batang jagung dan Scirpophaga excerptalis (Crambidae: Schoenobiinae) penggerek pucuk tebu. Ketiga spesies serangga tersebut telah dilaporkan dapat menurunkan hasil produksi tanaman pertanian di beberapa wilayah Indonesia. Identifikasi secara tepat dengan menggunakan karakterisasi morfologi dan molekular dapat membantu dalam pengendalian serangga tersebut. Karakterisasi morfologi dilakukan untuk mempelajari perbedaan morfologi. Kunci identifikasi yang ada hanya untuk Ordo Lepidoptera secara umum. Kunci identifikasi serangga penggerek berdasarkan morfologi pada level famili, subfamili, dan genus dalam Ordo Lepidoptera belum ada di Indonesia. Analisis molekular digunakan untuk mendukung data morfologi, sehingga identifikasi suatu spesies serangga akan lebih tepat. Genom DNA mitokondria (DNAmt) merupakan salah satu metode yang digunakan untuk mempelajari keragaman genetik dan hubungan kekerabatan suatu spesies. Gen DNAmt yang banyak digunakan dalam studi molekular sebagai penanda dalam analisis variasi genetik adalah gen Cytochrome c Oxidase I dan II (COI dan COII). Gen COI dan COII memiliki variasi genetik yang tinggi, tidak ada delesi dan insersi. Data molekular gen COI dan COII telah dilakukan untuk E. zinckenella di Italia dan Cina, O. furnacalis di Cina; Vietnam; dan Jepang, sedangkan S. excerptalis hanya ada untuk gen COII di India dan Papua Nugini. Data gen COI dan COII ketiga spesies penggerek tersebut di Indonesia belum ada. Oleh sebab itu, dilakukan karakterisasi molekular pada gen COI dan COII ketiga spesies tersebut sebagai database serangga penggerek di Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk (1) mengkarakterisasi perbedaan morfologi Genus Etiella (Pyralidae; Phycitinae), Genus Scirpophaga (Crambidae; Schoenobiinae), dan Genus Ostrinia (Crambidae; Pyraustinae). (2) mengkarakterisasi variasi gen COI dan COII DNA mitokondria E. zinckenella, S. excerptalis, dan O. furnacalis. Serangga E. zinckenella dari populasi Brebes (Jawa Tengah) dan O. furnacalis dari populasi Bogor (Jawa Barat) yang telah dipelihara di Laboratorium BB-Biogen. S. excerptalis dikoleksi dari pertanaman tebu di Tulang Bawang (Lampung). Tahap karakterisasi morfologi terdiri dari pengamatan karakter eksternal, preparasi venasi sayap dan organ genitalia. Karakterisasi molekular terdiri dari tahap ekstraksi DNA dengan metode CTAB, amplifikasi DNA, dan perunutan DNA. Analisis DNA dilakukan berdasarkan homologi sekuen DNA dan asam amino, serta analisis jarak genetik dan filogeni.