Eksplorasi Inhibitor Potensial dari Tanaman Herbal Indonesia terhadap Diadenosin Tetrafosfat Hidrolase dari Toxoplasma gondii (TgAp4AH)

Abstract

Toksoplasmosis adalah penyakit zoonosis menular yang disebabkan oleh parasit Toxoplasma gondii dan telah tersebar di seluruh dunia. Enzim Ap4AH dilaporkan telah menjadi target terapi baru dalam identifikasi inhibitor kuat, dan belum pernah dilakukan penelitian mengenai prediksi struktur enzim TgAp4AH dan identifikasi inhibitor potensial sebagai terapi pengobatan toksoplasmosis pada target TgAp4AH. Penelitian ini bertujuan melakukan prediksi struktur TgAp4AH dan mengeksplorasi inhibitor potensial dari tanaman herbal Indonesia. Pendekatan deep-learning pada AlphaFold2 digunakan sebagai program prediksi struktur TgAp4AH yang kemudian dilakukan identifikasi binding-pocket dan dilanjutkan penapisan virtual (VINA) serta penambatan molekuler (Autodock4). Sebanyak sembilan senyawa bioaktif teridentifikasi sebagai inhibitor potensial berdasarkan penapisan virtual VINA pada parameter energi ikatan (ΔG) dan konstanta disosiasi (Kd). Senyawa 8,8''-Biskoenigine, (-)-Calanolide B, dan Artonol B memiliki afinitas terbaik hasil penambatan molekuler Autodock4 dengan nilai energi ikatan terkecil.