Penambatan molekular senyawa flavonoid daun salam (Syzghium polyanthum Wight.) terhadap RdRp dan Endoribonuklease SARS-CoV-2

Abstract

RNA- dependent RNA polymerase dan Endoribonuklease merupakan protein non – struktural dari virus SARS-CoV-2 yang memiliki peran sintesis virus pada inang dan memainkan peran sentral dalam siklus replikasi dan transkripsi. Daun salam mengandung senyawa flavonoid yang memiliki berbagai macam peran sebagai antioksidan, antidiabetik, dan inhibitor lipase. Efektivitas senyawa flavonoid daun salam dalam proses penghambatan RdRp dan endoribonuklease belum diketahui. Penelitian ini bertujuan menganalisis potensi senyawa flavonoid daun salam sebagai inhibitor antivirus dari SARS-CoV-2 terhadap enzim RNA dependent RNA-polymerase dan endoribonuklease. Penelitian dilakukan dengan teknik penapisan virtual secara In silico melalui analisis energi bebas gibbs, konstanta inhibisi dan interaksi residu menggunakan YASARA structure. Sebagian besar senyawa flavonoid daun salam berpotensi sebagai inhibitor pada reseptor endoribonuklease dan RNA-dependent RNA polymerase SARS-CoV-2. Senyawa katekin pada daun salam memiliki potensi terbaik dalam menginhibisi enzim endoribonuklease dengan energi bebas gibbs -7,643 kkal/mol, KI 2,478 µM, satu ikatan hidrogen, dan 10 interaksi hidrofobik, sedangkan senyawa orientin pada reseptor RNA-dependent RNA polymerase memiliki potensi terbaik dalam menginhibisi enzim dengan energi bebas gibbs -5,662 kkal/mol, KI 70,341 µM, tiga ikatan hidrogen, dan 11 interaksi hidrofobik.