Aktivitas Antidepresan Senyawa Aktif Tanaman Ruku-Ruku (Ocimum sanctum L.) dengan Inhibisi Serotonin Transporter secara In Silico
Date
2022-07-08Author
Annisa, Alifia Mutiara
Kurniatin, Popi Asri
Purwanto, Ukhradiya Magharaniq Safira
Metadata
Show full item recordAbstract
Delesi serotonin menjadi salah satu faktor utama penyebab depresi.
Antidepresan berkembang pada target situs penting seperti pompa reuptake yaitu
selective serotonin reuptake inhibitors (SSRIs) yang menginhibisi human serotonin
transporter (hSERT). SSRI menjadi obat lini utama yang digunakan karena
kerjanya selektif pada peningkatan serotonin dan efek yang ringan. Ruku-ruku
memiliki metabolit sekunder yang berpotensi antidepresan. Penelitian ini bertujuan
mengidentifikasi dan menganalisis interaksi senyawa aktif tanaman ruku-ruku yang
dapat menginhibisi hSERT secara in silico. Tahap awal dilakukan skrining 60 ligan
uji menggunakan PyRx dan prediksi bioavailabilitas, toksisitas, serta
farmakokinetik menggunakan pkCSM dan AdmetSAR 1.0. Penambatan molekuler
dilakukan dengan Autodock Vina 1.5.6. Hasil diperoleh 6 ligan yang berpotensi
menginhibisi hSERT. Semua ligan tersebut berinteraksi dengan sekurangnya 6
residu penting yang terkonservasi pada tiga subsitus di situs pusat (S1) hSERT.
Interaksi polar pada subsitus A, serta interaksi nonpolar pada subsitus B dan C.
Ursolic acid memiliki ΔGbind paling negatif yaitu -10,7 kkal/mol dan Ki 0,014 µM,
serta dapat menembus sawar-darah otak sehingga dapat bekerja pada target sistem
saraf pusat. Serotonin deficiency is one of the major causes of depression. Antidepressant
development at specific sites such as reuptake pumps, namely selective serotonin
reuptake inhibitors (SSRIs) that act by inhibiting the human serotonin transporter
(hSERT). SSRIs are the main drugs that used because their selective and mild
effects on elevated serotonin levels. Ruku-ruku are known contain secondary
metabolites that have antidepressant properties. The study was conducted with the
purpose of identifying and analyzing the interactions of active compounds in the
ruku-ruku plant that might inhibit hSERT. First step was screening of 60 ligands
using PyRx and prediction of bioavailability, toxicity, and pharmacokinetics the use
of pkCSM and AdmetSAR 1.0. Molecular docking was done with Autodock Vina
1.5.6. The results identified 6 ligands that could inhibit hSERT. All these ligands
interact at six important conserved residues at three subsites at the central site (S1)
of hSERT. Polar interactions at subsite A, as well as nonpolar interactions at
subsites B and C. Ursolic acid has the most negative ΔG which is -10,7 kkal/mol
and Ki value of 0,014 µM. This ligan can penetrate the blood-brain barrier so that
it can work on the target of the central nervous system.
Collections
- UT - Biochemistry [1235]