Analisis In Silico Senyawa Bioaktif Daun Sirih Merah (Piper crocatum Ruiz & Pav) Terhadap Aktivitas Enzim Glutation Peroksidase
View/ Open
Date
2021Author
Umar, Mutmainnah Agustiawan
Safithri, Mega
Pratama, Rahadian
Metadata
Show full item recordAbstract
Glutation peroksidase (GPx) adalah salah satu antioksidan yang berperan
sebagai pelindung organisme dari stres oksidatif. Beberapa senyawa dalam tanaman
tertentu telah terbukti dapat meningkatkan aktivitas GPx. Sirih merah diketahui
memiliki kandungan senyawa antioksidan yang berpotensi meningkatkan aktivitas GPx.
Penelitian ini bertujuan untuk melihat potensi senyawa sirih merah sebagai aktivator
enzim glutation peroksidase. Daun sirih merah mengandung 44 senyawa aktif yang diuji
secara in silico yang diawali dengan preparasi reseptor dan ligan, dilanjutkan dengan
penentuan grid box, kemudian dilanjutkan ke tahap penapisan virtual dan penambatan
molekuler. Tahap penapisan virtual mengeliminasi 7 senyawa dan pada tahap uji
Lipinski terdapat 2 senyawa yang dieliminasi dan uji AdmetSAR yang mengeliminasi
21 sehingga terdapat 14 senyawa yang dilanjutkan ke tahap preparasi fail, penambatan
molekuler dan analisis interaksi ligan-reseptor. Parameter energi afinitas dan persentase
binding site similarity (%BSS) yang digunakan dalam analisis penambatan molekuler
menunjukkan bahwa terdapat beberapa senyawa yang berpotensi sebagai senyawa
antioksidan dengan meningkatkan kinerja enzim glutation peroksidase, senyawa terbaik
yang diidentifikasi adalah guanidine tartrate dengan energi afinitas -4,8 Kkal/mol dan
persen BSS sebesar 62,5 %.
Collections
- UT - Biochemistry [1327]