Analisis In Silico Senyawa Bioaktif Daun Sirih Merah (Piper crocatum Ruiz & Pav) Terhadap Aktivitas Enzim Glutation Peroksidase

Abstract

Glutation peroksidase (GPx) adalah salah satu antioksidan yang berperan sebagai pelindung organisme dari stres oksidatif. Beberapa senyawa dalam tanaman tertentu telah terbukti dapat meningkatkan aktivitas GPx. Sirih merah diketahui memiliki kandungan senyawa antioksidan yang berpotensi meningkatkan aktivitas GPx. Penelitian ini bertujuan untuk melihat potensi senyawa sirih merah sebagai aktivator enzim glutation peroksidase. Daun sirih merah mengandung 44 senyawa aktif yang diuji secara in silico yang diawali dengan preparasi reseptor dan ligan, dilanjutkan dengan penentuan grid box, kemudian dilanjutkan ke tahap penapisan virtual dan penambatan molekuler. Tahap penapisan virtual mengeliminasi 7 senyawa dan pada tahap uji Lipinski terdapat 2 senyawa yang dieliminasi dan uji AdmetSAR yang mengeliminasi 21 sehingga terdapat 14 senyawa yang dilanjutkan ke tahap preparasi fail, penambatan molekuler dan analisis interaksi ligan-reseptor. Parameter energi afinitas dan persentase binding site similarity (%BSS) yang digunakan dalam analisis penambatan molekuler menunjukkan bahwa terdapat beberapa senyawa yang berpotensi sebagai senyawa antioksidan dengan meningkatkan kinerja enzim glutation peroksidase, senyawa terbaik yang diidentifikasi adalah guanidine tartrate dengan energi afinitas -4,8 Kkal/mol dan persen BSS sebesar 62,5 %.