Analisis karakter pseudomonas sp. sebagai agen pemacu pertumbuhan tanaman dan biokontrol fungi patogen

Abstract

Beberapa galur bakteri rhizosfer dari kelompok Pseudomonas sp. telah cukup banyak diteliti belakangan ini. Hal ini terutama disebabkan kemampuan kelompok bakteri tersebut dalam meningkatkan pertumbuhan tanaman. Oleh karena itu, dalam penelitian ini diisolasi bakteri Pseudomonas sp. dari rhizosfer tanaman kedelai yang berasal dari Plumbon, Cirebon. Sebanyak 50 isolat Pseudomonas sp. berhasil diisolasi dengan menggunakan media semi selektif King’s B. 48 isolat mampu memproduksi asam indol asetat pada medium King’s B yang ditambah triptofan 0.5 mM. Sebanyak 9 isolat diantaranya secara signifikan dapat meningkatkan panjang akar primer, panjang batang dan/atau jumlah akar lateral dari kecambah kedelai. 33 isolat diketahui dapat memproduksi siderofor secara kualitatif pada medium CAS dan 13 isolat diketahui dapat memproduksi enzim kitinase. Untuk mengetahui aktivitas biokontrol dari isolat Pseudomonas sp., maka dilakukan uji penghambatan pertumbuhan fungi patogen tanaman yakni Sclerotium rolfsii, Rhizoctonia solani dan Fusarium oxysporum. Sebanyak 10 isolat berhasil menghambat F. oxysporum, 9 isolat dapat menghambat S. rolfsii dan 27 isolat menghambat R. solani. Berdasarkan karakter pemacuan pertumbuhan dan biokontrol kemudian terpilih empat isolat potensial yakni Crb-3, 16, 17 dan 44. Selain itu, ke-empat isolat potensial ini memperlihatkan hasil negatif pada uji hipersensitivitas yang mengindikasikan karakter non-patogenik. Berdasarkan analisis gen 16S-rRNA, Crb-3 memiliki homologi terbesar dengan P. monteilii, Crb-16 memiliki homologi terbesar dengan Pseudomonas sp. M41, Crb-17 dan Crb 44 berturut-turut memiliki homologi yang besar dengan P. plecoglossicida dan P. beteli. Deteksi gen yang terlibat dalam biosintesis senyawa antibiosis 2,4- diacetyl phloroglucinol dilakukan dengan teknik PCR dan hanya isolat Crb-16 yang terbukti positif memiliki gen penyandi DAPG dibuktikan dengan kemunculan amplikon sebesar ~745 pb.