Identifikasi dan Ekspresi Gen Elongase-Like 5 Ikan Gurami yang Diberi Jenis Pakan Berbeda

Abstract

Ikan air tawar dapat melakukan biosintesis eikosapentaenoat (EPA) dan dokosaheksaenoat (DHA), tetapi kadarnya rendah daripada ikan laut. Rekayasa genetik dapat meningkatkan EPA dan DHA pada ikan air tawar dengan tahap awal berupa melakukan identifikasi dan analisis ekspresi gen biosintesis EPA dan DHA seperti Elovl5. Ekspresi gen penyandi Elovl5 dapat ditingkatkan dengan pemberian pakan mengandung linolenat (LNA) dan linolenat (LA) dari tumbuhan seperti minyak biji rami, sehingga ikan air tawar harus mendapatkan LNA melalui pakan. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan menganalisis ekspresi gen Elongase-like 5 ikan gurami (OgElovl5) yang diberi jenis pakan berbeda berupa. Berdasarkan hasil identifikasi gen OgElovl5 dengan panjang 406 bp nukleotida yang menyandikan 135 residu asam amino. Kesamaan tertinggi sekuen nukleotida dan residu asam amino yaitu dengan gen Elovl5 ikan betok (Anabas testudineus). Dari hasil penyejajaran residu asam amino OgElovl5 dengan spesies lain didapatkan dua karakter khusus gen Elongase yaitu satu kotak histidin HTYHH dan dua wilayah transmembran. Analisis filogenetik menunjukkan kesamaan tertinggi gen OgElovl5 yaitu dengan gen Elovl5 ikan betok. Ekspresi gen OgElovl5 meningkat pada jam ke-3 dan menurun pada jam ke-6 setelah pemberian pakan. Tingkat ekspresi relatif tertinggi didapatkan pada pemberian pakan pelet uji minyak biji rami dibandingkan dengan pelet komersial dan daun sente.