Analisis Polimorfisme Gen MYF5|MspI serta Asosiasinya terhadap Sifat Pertumbuhan Sapi Bali

Abstract

Sapi Bali (Bos javanicus) merupakan sapi asli Indonesia yang telah diakui oleh FAO sebagai salah satu bangsa sapi di dunia. Sebagai SDGT potensinya perlu ditingkatkan terutama sebagai penghasil daging yang diharapkan dapat mendukung kebutuhan daging nasional. Pendekatan genetik menjadi salah satu fokus dalam penelitian ini terutama dalam mengidentifikasi gen-gen potensial yang berhubungan dengan sifat pertumbuhan. Gen Myogenic Factor 5 (MYF5) memiliki peranan penting dalam mekanisme pembentukan otot rangka sekaligus di ekspresikan paling awal di antara anggota MRF lainnya serta mengontrol proses myogenesis. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi SNP g.643G>A gen MYF5 kemudian mengasosiasikannya dengan sifat pertumbuhan pada sapi bali. Sampel darah diambil dari 80 ekor sapi bali yang terdiri dari 36 jantan dan 44 betina yang berumur 1.5-3.5 tahun yang dipelihara pada kondisi lingkungan yang sama di BPTU-HPT Denpasar Bali. Data fenotipe yang diamati meliputi; berat lahir, berat hidup, pertambahan bobot badan, panjang badan, dalam dada, tinggi pundak, tinggi pinggul, dan lingkar dada. Keragaman gen MYF5 diidentifikasi menggunakan metode PCR-RFLP. Asosiasi genotipe gen MYF5 dengan sifat pertumbuhan dilakukan dengan menggunakan General Linear Model oleh program SAS 9.4. Identifikasi keragaman gen MYF5|MspI bersifat polimorfik dan diperoleh tiga macam genotipe yaitu; AA, AG dan GG. Fragmen yang tidak terpotong oleh enzim MspI (1 fragmen = 285 pb) adalah genotipe AA, Fragmen terpotong (2 fragmen = 170 pb dan 115 pb) adalah genotipe GG, dan (3 fragmen = 285 pb, 170 pb, dan 115 pb) atau heterozigot adalah genotipe AG. Frekuensi genotipe AA, AG dan GG masing-masing adalah 0.04 (3), 0.30 (24), dan 0.65 (53). Frekuensi alel 0.19 dan 0.81 untuk alel A dan G. Analisis frekuensi gen menunjukkan bahwa sapi bali di BPTU-HPT Denpasar berada dalam keseimbangan Hardy-Weinberg. Asosiasi genotipe gen MYF5|MspI dengan sifat pertumbuhan sapi bali tidak berbeda nyata (P>0.05). SNP g.643G>A belum dapat dijadikan penciri genetik sifat pertumbuhan pada sapi bali.